低学年は5年生と6年生で構成され、新しいタイプの学校に適応するための重要な基礎となります。この2年間で、生徒たちは積極的にいろいろなことを試し、新しい学校環境や新しい教科にスムーズに移行する機会を与えられます。総合学校ではすべての学校卒業資格を取得できるため、この段階ではまだ特定の学校卒業資格を決めることに集中することはありません。その代わり、自分のスキルを幅広く試すことができ、場合によっては第二外国語に取り組むこともできます。
教科の授業内容に加えて、低学年の間は学習ストラテジーの開発にも特別な注意が払われます。個々の能力を目標を持って伸ばすためには、教科への主体的な取り組みを強化することが不可欠です。この側面は、特に低学年で集中的に実践されます。
低学年では、社会的スキルの習得にも重点を置いています。チームワークは、生徒が進学先で他の生徒と効果的に協力し、相互交流から利益を得られるようにするために、積極的に実践されています。